Propriétés physico-chimiques de l'ADN
Charge électrique de l'ADN
A pH physiologique, l'ADN est un polyanion en raison de la présence des groupements phosphates exposés au niveau de son squelette.
En conséquences, on observe:
- une solubilité élevée dans l'eau de l'ADN
- l'interaction avec des protéines basiques
- la migration vers l'anode lors de l'électrophorèse
- la nécessité de contre-ions (Na+, Mg2+) pour stabiliser la double hélice (forces de répulsion au niveau du petit sillon)
Propriétés spectrales
Absorbance des bases
Les bases azotées des acides nucléiques (ADN et ARN) absorbent fortement dans les UV entre 250nm et 280nm avec un pic d'absorption à 260nm.
Cette absorption est due à la présence des électrons Pi qui sont délocalisés au niveau des hétérocycles aromatiques de chaque nucléotides. Le niveau d'exitation des électrons Pi (et donc l'absorbance) dépend de l'environnement. Ainsi, l'absorbance d'un ADN double brin sera plus faible qu'un ADN simple brin. Les nucléotides libres étant l'état le moins stable pour les bases. C'est l'effet hyperchrome.
Pour calculer la concentration des ADN et ARN, il est admis de d'utiliser des coefficients d'extinction molaire approximatifs, avec les valeurs suivantes :
- pour ADN double brin = 50ng.cm/µL
- pour ADN simple brin = 33ng.cm/µL
- pour ARN = 40ng.cm/µL
Effet mutagène des UV
L'exposition de l'ADN aux UV peut provoquer des lésions irréversibles, comme la formation de dimères de thymine qui perturbent la réplication entraînant des mutations.
